本发明公开了一种利用工业磷酸制备过程中的副产物氟硅酸中的硅铝磷元素合成分子筛的方法及应用，氟硅酸氨化法制二氧化硅：加入工业氟硅酸，加热，然后加入氨水，反应，测量反应终温，测量pH，陈化、过滤，滤饼烘干称重得到二氧化硅；合成SAPO‑34\SAPO‑5分子筛。本发明通过使用磷肥工业副产物氟硅酸作为分子筛中的硅、铝和磷源与氟源，提高氟硅酸的利用率，并且提高磷酸副产物中氟硅酸硅元素的附加价值。另将制备的分子筛用于磷肥副产磷石膏库渣场回收废水工业废水脱氟应用，实现循环经济。