本发明涉及医疗器械技术领域，具体涉及一种药物涂层、药物涂层球囊及其制备方法，所述药物涂层包括依次附着于基体表面的药物活性涂层和正电疏水修饰层，包括正电修饰物质和疏水性物质的正电疏水修饰层的设置使得整个药物涂层表面带正电且具有疏水性，正电特性使得其与带负电荷的血管内壁能够强力结合，让药物涂层持久吸附于血管内壁，搭配疏水特性能够有效抵抗输送过程中血流对药物涂层的冲刷影响，通过上述结构的药物涂层不仅能够降低药物球囊输送过程中药物的损失，还能降低药物在球囊扩张收缩过程中的损失，同时提高药物转移到血管内壁上的量。