本发明涉及一种含猪圆环病毒3型、猪圆环病毒2型抗原的免疫原性组合物，其中，该免疫原性组合物包括免疫量的猪圆环病毒3型抗原、免疫量的猪圆环病毒2型new基因亚型抗原以及药学上可接受的载体。该免疫原性组合物具有良好的免疫原性，一次免疫即能完全保护猪圆环病毒3型、猪圆环病毒2型的混合感染。