本发明涉及散热器热仿真技术领域，特别是涉及一种散热器热仿真参数的筛选方法及系统，其根据结温序列与第j次调整热仿真参数后的K个热源的热仿真温度序列计算每个热源的温差得到温差序列，根据温差序列和温差阈值的大小将热源分为第一类热源和第二类热源，并得到第一类热源的数量占比；对第二类热源的功耗进行取对数处理得到新的功耗，得到更新后的功率序列，根据更新后的功率序列中每个热源的功耗占比分配权重；根据权重和温差序列计算离散程度；根据离散程度和数量占比计算置信权重，并根据N次调整热仿真参数得到的置信权重选取最优仿真参数，能够有效并且快速的选取最优仿真参数，不依赖于人为主观经验，不受主观因素的影响。