本实用新型属于消毒器技术领域，尤其涉及一种消毒器控制电路及手持消毒器，所述消毒器控制电路包括供电输入电路、输出驱动控制电路和灯管升压驱动电路，所述输出驱动控制电路的第一端与所述供电输入电路连接；所述灯管升压驱动电路的一端与所述输出驱动控制电路的第二端连接，所述灯管升压驱动电路的另一端与一灭菌灯管连接并用于驱动灭菌灯管发光。本实用新型中整个消毒器控制电路的电路结构简单，降低了研发成本及生产成本，且所需要的电子元器件较少，进而同时降低了消毒器的整体重量，提升用户的使用体验，满足用户的使用需求，具有极高的实用性。