本发明属于生物技术领域，公开了一种生产苹果酸的方法，包括如下步骤：取苹果酸发酵液，离心去除沉淀，收集上清液，然后添加活性炭，搅拌，再添加硅藻土，搅拌均匀，板框过滤，收集滤液，再进行微滤膜过滤，收集微滤液，通过装填有强碱弱酸型两性离子交换树脂的色谱柱，使其中的苹果酸被吸附，然后用热水洗脱吸附于树脂上的苹果酸，反复洗脱，将得到的洗脱液合并，减压蒸馏，真空干燥，得到苹果酸产品。