本实用新型涉及一种电动百叶窗传动机构，包括：传动组件、卷绳轴和翻转轴，传动组件包括驱动轴和从动轴，驱动轴与从动轴轴向平行设置，驱动轴上套设有第一齿轮和第二齿轮，第一齿轮和第二齿轮与驱动轴之间均设置有单向轴承，且两个单向轴承的安装方向相反；从动轴上套设有从动齿轮，从动齿轮均与第一齿轮和第二齿轮啮合，从动齿轮与第一齿轮啮合区域设置有第一缺齿部，从动齿轮与第二齿轮啮合区域设置有第二缺齿部；卷绳轴与驱动轴连接；翻转轴与从动轴连接。本实用新型避免了大大减少翻转部分转动时间，减小了翻转绳的摩擦时间，延长翻转绳的使用寿命。