本发明公开了正骨水的指纹图谱构建方法及其指纹图谱，该构建方法包括如下步骤：(1)供试品的制备：精密取正骨水，用乙醇水溶液稀释并定容，摇匀，过滤，取续滤液，即得供试品溶液；(2)精密吸取供试品溶液，注入高效液相色谱仪，得正骨水的指纹图谱。本发明经发明人的大量实验和研究，确定了制备供试品溶液的方法及高效液相色谱仪的色谱条件的最优参数，由此构建出正骨水的指纹图谱，并将其应用到正骨水的质量控制当中，从而保证了不同操作者、不同实验室多重复做出的指纹图谱都在允许的误差范围内，体现了所述指纹图谱的通用性、稳定性和实用性，能够全面、有效地对正骨水进行质量控制。