本发明涉及一种车载空气净化器控制系统、控制方法及应用该控制系统的车载空气净化器，属于车载空气净化领域。该车载空气净化控制系统包括电路控制模块、信号收集‑分析模块、中央处理器、风机模块和用户提醒模块，通过特定控制方法控制此系统，使车载空气净化器能够根据汽车运动状态自动开启和关闭，并对开启和关闭条件作出优化使控制方法更人性化，客户体验更好；本发明还公开了一种应用上述控制系统和控制方法的车载空气净化器，不仅保证了车载空气净化器控制的合理化、人性化，而且结构巧妙，外表设计大方、美观。