本实用新型公开了一种具有水箱杀菌系统的净水器，具有循环杀菌水路，所述循环杀菌水路的入水口和出水口均设置在水箱中，在循环杀菌水路中设置有循环泵和循环杀菌模组。本实用新型公开的具有水箱杀菌系统的净水器，解决了水箱存水细菌繁殖超标的问题，且不会加速水箱老化，提高了净水器的使用寿命。