本实用新型涉及马桶喷枪技术领域，尤其为一种除菌装置及具有该除菌装置的马桶喷枪，包括：除菌装置，所述除菌装置包括多个框架单元，用以存储杀菌药剂和连接外接水源；开关机构，所述开关机构用于开启和关闭杀菌药剂，从而对马桶进行消毒；喷枪头，所述喷枪头用于控制水源的开启和关闭；喷枪管道，所述喷枪管道方便清洗的水和药剂通过，从而通过L形杆带动第二活塞板在第二套筒内部滑动挤压空气，空气通过管道由第二套筒进入第一套筒，带动第一活塞板上升，从而使阀块内部的通槽与吸料管对应，在水流的负压作用下，除菌筒内的清洗液会被抽入喷枪管道，随着水流一起排出进行消毒，能在冲洗马桶的同时进行消毒，使用方便。