本发明属于提纯工艺技术领域，具体涉及一种荷叶生物碱单体的提纯系统及提纯工艺，涉及提取、初级纯化和精制。本发明的提纯系统，将提取装置和初级纯化装置串联使得荷叶中有效物质的循环提取和富集同步进行，构建得到连续化工艺，且提取试剂的用量更加节约；采用制备液相法进行精制，同时获取多个高纯度荷叶生物碱单体。