本实用新型公开了一种发酵菌种液体培养系统，包括发酵罐和空气压缩机，发酵罐上设置有罐口，罐口上密封覆盖有收缩膜，发酵罐的侧壁上还设置有进气口，进气口上连接有管道，管道与空气压缩机连接；管道上依次开有三个插口槽，第一个插口槽内插设有甲醛过滤网，第二个插口槽内插设有有害菌过滤网，第三个插口槽内插设有活性炭过滤网；本实用新型的有益效果是：通过三层滤网有效的将空气中所含的有害物质以及灰尘除去，提高了罐内菌液的发酵效果，同时通过插口槽的设置方便了甲醛过滤网、有害菌过滤网和活性炭过滤网的更换，使清洗工作变得更加简单，而波纹齿形状的活性炭过滤网和带有蜂窝状活性炭层的甲醛过滤网则提高了空气的洁净度。