本发明公开了一种用于心肌保护的药物的制备方法，包括以下步骤：（1）将一水肌酸溶于NaOH水溶液，滴加POCl3，加入纯化水，得到含化合物II的滤液备用；（2）将上述滤液调pH后，加入BaBr2，加入溶剂析出磷酸肌酸钡；（3）将磷酸肌酸钡溶于纯化水，加入一种钠盐沉降Ba2+，加入酸第一次调节pH，用10％硫酸溶液检测钡离子残留，合格后过滤，加入酸第二次调节pH，降温至‑5‑15℃，加入溶剂析晶，得到磷酸肌酸钠。本发明通过对合成磷酸肌酸钠合成工艺的优化筛选，简化处理工艺，降低生产成本，其收率达到50％以上，得到的产品纯度大于99％，含量在98‑101％，符合药用质量要求。