本实用新型公开了一种双压氢气压缩机，包括：压缩机组一，其通过二级增压将进气压力为5～30Mpa的气体加压后输出为45MPa储罐组，供给35MPa加氢机或作为输出端直接连接至压缩机组二的进气口；压缩机组二，其通过三级增压将压缩机组一的输出端或者45MPa储罐组的气体加压后输出为90MPa储罐组，供给70MPa加氢机。本实用新型使得一套压缩机同时满足35MPa/70MPa双压加氢站建设需求、35MPa加氢站升级需求，通过分级增压，降低压缩机的能耗和排气温度，同时满足多种应用场景，应用前景广泛，使用范围广。