本实用新型涉及益生菌发酵技术领域，且公开了一种新型的益生菌剂发酵装置，包括底板，所述底板的上表面固定安装有益生菌剂发酵装置本体，所述益生菌剂发酵装置本体远离底板的一侧活动连接有顶盖。本实用新型通过一号刮板、二号刮板、主动齿轮和从动齿轮之间的配合，利用齿轮传动的远离，实现主动齿轮的转动带动从动齿轮的同步转动，实现了一号刮板和二号刮板对益生菌剂发酵装置内壁刮刷的效果，有效地解决了益生菌发酵过程中原料依附在益生菌剂发酵装置内壁的问题，对原料的及时刮刷，减少了益生菌发酵过程中原料的浪费，同时还避免了原料长时间依附在益生菌剂发酵装置内壁造成原料的变质对下一批益生菌发酵的污染。