本发明公开了一种高产率提取甘薯蛋白的方法，本方法包括以下步骤：①超低温冷冻预处理，②甘薯冰渣的制备，③甘薯浸提液的制备，④磁场作用下离心纯化，⑤膜透析纯化，⑥真空冷冻干燥。本发明的甘薯蛋白的提取方法相对传统工艺来讲工艺简单，制备甘薯蛋白的产率高，所得甘薯蛋白纯度高，制备条件温和可制得活性强的甘薯蛋白。