本发明涉及乳制品生产设备技术领域，公开了一种乳制品灌装消毒设备，包括输送台，所述输送台上沿输送方向依次设置有分料结构、灌装结构以及检测结构，所述灌装结构包括原料罐，所述原料罐的内部通过隔板分隔为上方的第一腔室和下方的第二腔室，所述第二腔室的侧壁内嵌装有电加热管，所述第一腔室内安装有用于控制电加热管启闭的开关组件，所述第二腔室内安装有用于推料的活塞，所述活塞的底部两侧设置有用于控制灌装量的电位组件。本发明能够根据第二腔室内的温度变化情况实现对于电加热管的启闭控制，提高了温度控制的及时性、准确性，并且每次灌装时乳制品的液位变化保持恒定，保证了灌装量的一致性。