本发明属于层状包装薄膜材料技术领域，具体为一种具有高阻隔高抗菌性能的包装薄膜材料、制备方法及应用。通过设置铝箔层、氮氧化硅层、防护层，并且将氮氧化硅层设置为具有多个循环的不同倾斜组织排列方向的子膜层对结构，提高了包装薄膜材料的阻氧阻水性能、抗菌抑菌性能、抗冲击性能。