本发明公开了一种过瘤胃氯化胆碱微胶囊及其制备方法，该微胶囊包括由氯化胆碱和载体组成的芯材、内层包膜和外层包膜，内层包膜的原料包括一种或一种以上熔点高于60℃的植物脂肪；所述外层包膜的原料包括米糠蜡、氧化锌粉末和成膜材料；所述成膜材料为邻苯二甲酸葡萄糖、聚乙二醇或海藻酸钠；所述米糠蜡的含量为5～10％，米糠蜡、氧化锌粉末和成膜材料的质量比为1～5：0.1～1：0.1～1。本发明采用米糠蜡、氧化锌粉末和成膜材料作为外层包膜的原料，不仅显著提高了过瘤胃氯化胆碱微胶囊在反刍动物瘤胃中的过瘤胃率和在小肠中的释放率，还降低了产品在存放和使用过程中的吸湿性，从而有效提高了提高反刍动物对氯化胆碱的利用效率。