本发明公开了一种苏云金芽孢杆菌以色列亚种毒素蛋白的定量检测方法，它是在现有苏云金芽胞杆菌毒素蛋白含量测定方法的基础上，通过采用特殊的样品预处理方法，解决了试样中杂质干扰毒素蛋白定量检测的问题，同时对SDS–PAGE凝胶配方进行了优化，进一步改善了凝胶电泳图谱中两种蛋白带的迁移率、分辨率和蛋白带形态，使测得的结果更加准确。本发明能用于Bti类产品的质量控制，具有操作简单易行、快速、成本低、受外界环境影响小等优点。