本发明公开了一种含有双胍三辛烷基苯磺酸盐和几丁聚糖的杀菌组合物，有效成分为双胍三辛烷基苯磺酸盐和几丁聚糖，双胍三辛烷基苯磺酸盐和几丁聚糖的质量份数比为40:1～1:10，双胍三辛烷基苯磺酸盐和几丁聚糖质量总和在杀菌组合物中的重量百分比为0.05％‑90％；本发明杀菌组合物适用于防治小麦白粉病、草莓白粉病、柑橘青霉病、柑橘酸腐病、柑橘炭疽病、黄瓜霜霉病、水稻纹枯病、水稻稻瘟病、马铃薯早疫病、马铃薯晚疫病、西瓜炭疽病；本发明降低了农药的使用剂量，减少了农药对环境的影响，降低了用药成本，能延缓或克服病害抗药性的产生，延长药剂的使用寿命，有利于病害的综合治理。