本发明提供一种用于天然气门站的独立供电系统。所述系统包括：燃料电池发电单元以及为燃料电池发电单元提供氢气的制氢单元，压差发电单元，输入端与燃料电池发电单元和压差发电单元相连、输出端与用电负载相连的电力分配单元；压差发电单元与天然气调压回路并联，基于天然气的压力差产生电能和冷能，所述冷能加至制氢单元用于吸收制氢过程产生的热量。本发明利用天然气门站调压区废弃未利用的压力动能通过压差发电单元产生电力和冷能，解决了供电问题，能源利用率高，具有很好的经济效益；本发明将压差发电单元产生的冷能用于吸收制氢单元制氢过程产生的热量，进一步提高了能源利用率。压差发电单元还具有调压稳压作用，可取代天然气调压回路。