本发明公开了一种灵芝孢子粉的复合破壁处理方法。所述复合破壁处理方法包括如下方法：在静置状态下，采用灵芝菌丝体液态深层培养发酵液或其滤液对灵芝孢子粉进行浸润式萌发培养和孢壁酶解；经所述浸润式萌发培养和孢壁酶解后的所述灵芝孢子粉经干燥后进行机械破壁，即实现所述灵芝孢子粉的复合破壁处理。本发明方法对灵芝孢子粉进行萌动激发和孢壁酶解双重处理后，结合液氮低温脆化处理，不仅可以大幅缩短机械破壁处理时间，更好保存活性成分，有效减少机械杂质和重金属污染，避免外源酶污染，而且可以有效提高灵芝孢子粉的破壁率，实现灵芝孢子粉的绿色高效破壁。