本发明提供一种燃料电池空压机测试方法及系统。测试方法的步骤为：计算燃料电池堆所需的空气流量和空气压力值；采用电堆模拟器连接空压机，设定空压机转速，并实时调节和检测电堆模拟器的消耗空气流量和入口空气压力值，当调节后的检测值达到所需空气流量和空气压力值时，空压机匹配燃料电池堆，否则进入一下步骤；提高空压机转速，若调节后的检测值达到所需的空气流量和空气压力值，则空压机匹配燃料电池堆；若空压机提至最高转速时仍无法达到，则空压机不匹配燃料电池堆。测试系统包括电堆模拟器、压力测试组件及流量测试组件，压力测试组件和流量测试组件分别与电堆模拟器连接。本发明具有测试方便、测试准确性高，且结构紧凑等优点。