本发明公开了一种共轭亚油酸的生产方法，属于油脂的化学合成方法领域，包括对原料为含有亚油酸的化合物进行酯交换反应，酯交换反应时将产物进行精馏分离，再将分离得到的亚油酸短醇酯进行碱催化异构化、皂化、酸解、水洗后得到共轭亚油酸。本发明的生产工艺能连续且高效的进行，具有制备工艺简单、反应条件温和、原料利用率高、产品纯度高、产品稳定性高的优点；能耗低，既降低了生产成本，又降低了对环境的污染，适合规模化生产。