本发明涉及电流检测技术领域，尤其涉及一种GNSS模块的电流检测系统及其检测方法。本发明提供一种GNSS模块的电流检测系统，包括单片机，所述电流检测系统还包括与所述单片机相连、分别检测GNSS模块的常用电源电压和备用电源电压的电压检测模块。本发明检测方法包括：由备用电源检测电路获取GNSS模块的备用电源的电压值，传输给所述单片机；由常用电源检测电路获取GNSS模块的常用电源的电压值，传输给所述单片机。本发明改变现有技术对GNSS模块常用电源和GNSS模块备用电源的电流测量的方式，从而提高对GNSS模块备用电源电流测量和GNSS模块常用电源电流测量的自动化，使得所测得的数据能够被上位机记录、保存和分析。