本发明提供了一种用于治疗大菱鲆盾纤毛虫病的药物组合物及其应用，属于药物领域，其活性成分由姜黄提取物和脂肪醇聚氧乙烯醚硫酸钠组成，所述姜黄提取物为姜黄药材的提取物，所述姜黄药材与脂肪醇聚氧乙烯醚硫酸钠的重量比为（100～400）：4，可选地为200：4、100:4或400:4。通过体外杀虫试验和动物感染试验证实添加姜黄和脂肪醇聚氧乙烯醚硫酸钠（AES）可杀灭盾纤毛虫，可使大菱鲆盾纤毛虫感染率、死亡率明显降低，具有较好的抗盾纤毛虫作用。姜黄和脂肪醇聚氧乙烯醚硫酸钠（AES）联用后，杀虫效果有明显提高。首次发现姜黄乙醇提取液和脂肪醇聚氧乙烯醚硫酸钠（AES）联用可以增强杀灭盾纤毛虫的效果。