本发明公开了一种中药组合物及其在水生动物抗病毒药物中应用。本发明所述的中药组合物提取自中药原料空心苋、甜菊叶、荞麦壳和黑丁香，所述中药组合物具有延缓病害的发生时间，降低发病严重程度，降低死亡率，提高患病动物的存活率的功效，对预防、缓解或治疗常见水生动物病毒病有良好的预防及治疗效果，有效率达70%以上，减少了病毒病造成的损失。