本发明公开了多功能凝结芽孢杆菌在益生菌坚果制作中的应用，属微生物应用技术领域和食品加工技术领域。本发明的凝结芽孢杆菌具有多种优良性能，其用于益生菌坚果的制作，不仅赋予益生菌坚果更好的品质，还赋予其更高的安全性。本发明的益生菌坚果制作工艺，通过该工艺加工生产的益生菌表面裹粉均匀美观且不宜掉粉、食用时不脏手。益生菌坚果表面的裹衣粉形成一层保护层，可阻止氧气与坚果表面接触，同时与益生菌坚果中的雨生红球藻以及充氮包装、吸氧剂协同作用可延缓坚果氧化哈败，降低坚果表面氧化哈败，保证益生菌坚果质量。