本实用新型属于独轮车控制技术领域，提供了一种电动独轮车及其控制系统，电动独轮车的车轮由电机驱动，控制系统内置供电电源，该控制系统包括辅助电源模块、主控模块、驱动模块以及感测模块，供电电源通过辅助电源模块对主控模块进行供电，主控模块根据感测模块获取到电动独轮车的角度信号以及结合电机提供的反馈信号，控制驱动模块驱动电机运行。由此通过辅助电源模块输出主控模块、驱动模块以及感测模块所需的电源电压，提高了整体的供电效率；以及主控模块根据电动独轮车的角度信号和电机提供的反馈信号控制驱动模块，使得电机最终按照驱动模块的控制方式运行，该控制方式稳定性高。