本发明提供一种微管生产纤膏填充系统，包括纤膏桶以及挤塑机头，所述纤膏桶的出口端连接第一电机，所述第一电机与纤膏储存容器连接，所述纤膏储存容器的输出端分别连接微管纤膏差速第一电机与纤膏泵集成装置以及常规纤膏泵，所述微管纤膏差速第一电机与纤膏泵集成装置以及常规纤膏泵均与电动执行阀连接且微管纤膏差速第一电机与纤膏泵集成装置以及常规纤膏泵并联连接，所述电动执行阀输出端连接纤膏输送管，所述纤膏输送管与充油模具的入口端连接，所述充油模具的出口端与挤塑机头连接，该设计无需对原有设备进行拆卸破坏，降低改造风险，降低设备投资成本，降低人员拆卸更换时效，提高设备利用率。