本发明公开一种时序数据库的数据删除方法及系统，方法包括步骤：将多个时序数据库构建为一个组；将所有的组统一管理；以组为单元进行删除。需要对时序数据库进行删除时，以组为单元进行删除，因为一个组由多个时序数据库构建而成，同组的实例有的在执行删除，有的实例为正常的实例，用户此时查询正在执行删除任务的组时可以通过其他未执行删除的实例获取正常的结果，可以使得现有的时序数据库可以正常而快速的执行删除任务，当用户的删除数据量特别大时，也不会影响用户的正常查询数据的请求，并且保证了用户在整个过程获取的数据都是正确且一致的。