本发明公开了阻挡装置及自动化输送系统，涉及自动化物流输送技术领域。本发明提供的阻挡装置包括基座、减速电机、偏心构件、配重挡板及检测器。减速电机安装于基座上，偏心构件包括偏心轮、检测片及限位件，偏心轮与减速电机传动连接，检测片设置于偏心轮并凸出偏心轮边沿设置，检测器安装于基座上并与检测片配合，配重挡板与偏心轮转动连接，限位件设置于偏心轮并与配重挡板配合。检测器与减速电机电性连接，以在检测到检测片时向减速电机发送控制信号。本发明还提供了一种包括阻挡装置的自动化输送系统。本发明提供的阻挡装置及自动化输送系统具有占地空间位置小及布置简单灵活的特点，还具有更低的高度，能够适用移动输送设备。