本发明公开了一种阻燃胶粘剂及其制备方法与应用，所述阻燃胶粘剂包括以下按重量份计的组分：第一环氧树脂100份，活性稀释剂5‑15份，增韧树脂10‑15份，阻燃剂10‑20份，第一固化剂30‑50份，所述阻燃剂具有壳核结构，其中核层为可膨胀石墨，壳层包括依次包覆在所述可膨胀石墨外表面的聚丙烯酸酯包覆层、氢氧化镁包覆层、环氧包覆层。本发明的阻燃胶粘剂阻燃剂添加量低，具有优异的阻燃性能和良好的力学性能，克服了现有环氧阻燃胶粘剂难以兼顾阻燃性和力学性能的缺陷。本发明还提供上述阻燃胶粘剂的制备方法与应用。