本实用新型公开了一种不影响菌种活性的超微粉碎机，包括粉碎箱，所述粉碎箱内设有粉碎结构和温度调节结构；其中，粉碎结构包含有：进料管、操作箱、轴承、旋转轴、旋转电机、主动齿轮、从动齿轮、若干结构相同的粉碎刀片、超声波发生器、过滤网以及出料管；所述操作箱安装在所述粉碎箱上壁面上，所述粉碎箱上壁面开设有通孔，且位于所述操作箱左侧，所述进料管安装在所述粉碎箱上壁面开设的通孔处，所述轴承嵌装在所述操作箱内上壁面中心，本实用新型涉及超微粉碎机技术领域,解决了现有的超微粉碎机在使用过程中，容易由于温度过高或者过低从而影响菌种的活性的问题。