本实用新型涉及空间转录组技术领域，提供一种空间转录芯片夹持装置。包括：座体、盖体和弹性件；其中，盖体包括扣合状态和打开状态，在扣合状态，盖体扣合于座体，在打开状态，盖体从座体打开；盖体与座体扣合的一侧能够安装空间转录芯片，弹性件的第一端与座体连接，第二端凸出于座体以用于与空间转录芯片相抵，弹性件设有沿第一端至第二端贯通的贯通孔，座体与贯通孔相对的位置设有贯通设置的反应槽。由于弹性件的第一端与座体连接，第二端与空间转录芯片相抵，而受到座体与空间转录芯片的挤压，从而能够压紧空间转录芯片，防止空间转录芯片松动，并且弹性件与座体之间以及弹性件与盖体之间均具有密封效果，从而不会漏液的问题。