本发明实施例提供一种基因组的组装方法及装置，所述方法包括：获取纠错后的基因信息，所述基因信息包括基因组和比对信息；根据所述基因组和所述比对信息进行基因组组装；若判断获知组装结果未达到预设条件，对所述组装结果进行分区域聚类处理，并将处理结果进行重新组装。所述装置执行上述方法。本发明实施例提供的基因组的组装方法及装置，通过将未达到预设条件的组装结果进行分区域聚类处理，并将处理结果进行重新组装，能够提高基因组组装通用性和准确性。