本发明公开了一种节能环保的椰果包杀菌工艺，包括以下步骤：A、将封装好的椰果包在杀菌装置的除尘腔室进行除尘处理；B、椰果包进入加热腔室，高频振动器启动，振动椰果包；C、进行热杀菌处理；D、椰果包进入杀菌装置的冷却腔室进行冷却处理；E、椰果包进入杀菌装置的紫外杀菌腔室进行紫外杀菌处理；F、椰果包在杀菌装置的收集腔室进行回收。本发明具有杀菌过程干燥，产品可以直接应用于成品工序、节约水资源的优点。