本发明涉及信息处理技术领域，公开了一种数据处理方法及数据处理装置。该数据处理方法包括：根据测序仪的采样规律，建立测序芯片中各反应单元与原始数据文件中所述各反应单元的输出数据的存储位置的一一映射关系；根据所述一一映射关系，从所述原始数据文件中提取出任一反应单元的输出数据。本发明的实施方式还公开了一种数据处理装置。本发明实施方式相对于现有技术而言，通过建立测序芯片中各反应单元与原始数据文件中所述各反应单元的输出数据的存储位置的一一映射关系，使得可根据该一一映射关系，准确地从测序仪采集的原始数据中挑选出芯片中任一反应单元的输出数据，大大节省了查找反应单元的输出数据的时间。