本发明涉及微流体芯片技术领域，公开了一种微流体芯片进样系统及适配管。该微流体芯片进样系统，包含：微流体芯片、负压产生装置、用于盛放样品的容器；所述微流体芯片具有流体通道，所述流体通道具有通道入口和通道出口；所述负压产生装置通过适配管与所述通道出口连通；所述适配管具有单向阀结构，用于阻止气体从所述通道出口回流进所述流体通道内。该适配管，应用于上述的微流体芯片进样系统中，所述单向阀结构包括设置在所述管体内的轻质阀芯。本发明的微流体芯片进样系统实现了样品充满的均一性，还能有效节省珍贵样品的用量。本发明的适配管使样品的进样效果更为优异。