一种应用于空间站的细胞冻存装置，属于空间生物细胞冻存领域，本发明为解决了现有空间站无法实现细胞长期冻存及不适合细胞转移的问题。本发明通过将空间站内部实验室经程序降温处理冻存后的细胞，经封装通过空间站细胞专用舱门输送至空间站外冻存驱动载体上，并根据空间站不同位姿自动调整到背阳面实现长期稳定冻存。本发明通过可控旋转的冻存驱动载体，并通过输送机构将不同的细胞冻存到设定位置，充分利用冻存空间，可实现同时多批次、多种类细胞的冻存，减小空间站内部实验空间、减少内部电能损耗和多余的内部热源。本发明适用于空间站冻存细胞使用。