本发明公开一种氢气生产系统，包括生物质气供应装置、富含甲烷气体供应装置、预处理装置、第一组分分离装置、第二组分分离装置、催化裂解及变换装置、第三组分分离装置、第四组分分离装置、燃料气总管和控制装置。本发明能够回收并充分利用低值低品位、组分及资源量变化幅度大、且含有各种非可燃组分和杂质的生物质气与富含甲烷气，达到对生物质气、富含甲烷气物尽其用、价值最大化目标，解决资源浪费与排放污染问题。本发明还公开一种氢气生产方法。