本发明提供一种永磁同步电机旋变初始零位角校准系统及校准方法，属于电机校准领域。本发明校准系统，包括上位机、校准台架，所述校准台架上设有带动被测电机转动的稳速电机、用于获取被测电机转矩的转矩仪，所述稳速电机包括稳速控制器和与稳速控制器相连的第一电机，被测电机包括被测控制器和与被测控制器相连的第二电机，所述第一电机和第二电机通过连接轴同轴连接，所述转矩仪与连接轴相连，所述上位机分别与转矩仪、被测控制器和稳速控制器相连，所述上位机控制被测电机和稳速电机运动。本发明能够满足高速功率需求，提高检测精度，有效降低现有产品缺陷；降低成本，减少人工强度，提高调整效率。