本发明涉及一种移动时MBR膜系统应急维护装置及其使用方法，包括设备间、好氧池、膜池、清水池、碱洗池、酸洗池和用于提升站点膜组器的膜架起吊装置；设备间内设置有电控柜、进水泵、鼓风机、膜产水泵和膜清洗喷淋装置；进水泵分别与好氧池和膜池相连接；膜产水泵与膜清洗喷淋装置均与清水池相连接；好氧池内设细格栅和曝气充氧装置；膜池内设有用于控制膜池混合液回流的气提回流装置、膜池膜组器和电加热器。其具有结构和工序简单，设计合理，便于标准化运输、具有良好的机动性，便于操作维护管理，适应能力强，可靠性高等特点，能够被适用于分散式污水处理处理站的临时性、应急性污水处理服务和MBR工艺站点膜组器原位化学清洗服务。