本发明公开了一种城市污水厂网一体化的控制方法及系统，属于污水处理技术领域，所属方法以“总量控制、持续提升”为核心理念，针对城市排水系统，提出“平台构建、雨污分流同步、厂网协同”的运营方法，实现排水系统减排效益提升和提质增效。包括：建立统一监控平台，实现数据采集、诊断及调度；建立基于物料守恒的混接比评估模型，快速诊断混接程度和区域，提高雨污分流效率；建立基于综合污染指数总量削减目标的线性模型，根据系统最大水力负荷、最不利点液位控制以及单污染因子超标限值，作为限定条件，完成泵站提升量优化配置，提升降雨期污染削减能力；建立基于泵站水质水量前反馈的污水厂曝气量控制模型，提升抗冲击负荷能力，降低能耗。