本发明公开一种有机磷农药污染土壤异位修复系统，包括土壤淋洗单元、调节池和废水一体化处理单元，土壤淋洗单元为多阶段反向土壤淋洗单元，废水一体化处理单元包括依次连接的反应池、混合池、絮凝沉淀池、砂滤池、清水池，反应池设pH调节剂投加口、Fe‑TAML和H2O2投加口，混合池设PAM投加口，土壤淋洗单元的废水出口和调节池连接，调节池再和反应池连接，清水池大部分出水回用作清洁淋洗剂，少部分出水作为砂滤池反冲洗水源。本发明还公开有机磷农药污染土壤异位修复方法。通过多级反向淋洗污染土壤，淋洗废水通过废水一体化处理单元处理，出水大部分作为淋洗剂循环回用，形成半闭环系统，修复污染土壤，也实现资源循环利用。