本发明提供了一种基于专变采集终端的电能质量监测方法及系统，涉及数据处理技术领域，根据电能质量评估的监测指标确定专变采集终端的数据采集源并对应构建数据传输通道，对数据采集源进行数据特征识别，输出异常识别结果，将异常识别结果进行数据纠正获得数据转换结果，将数据转换结果传输至电能质量监测系统进行电能质量评估。解决了现有技术中对专变用户进行电能质量评估过程中，存在电能质量评估数据采集精度不足，导致电能质量评估结果在电力运维中参考价值较低的技术问题。达到了提高进行专变用户电能质量评估相关数据采集精度，提高专变用户电能质量评估结果在电力运维中的可参考性和有效性，实现确保专变用户的用电安全的技术效果。