本申请涉及一种清洁饲料微生物检测用快速取样装置，属于清洁饲料检测的领域，其包括套杆、内杆和定位机构，套杆内部中空且两端开口设置，内杆滑动设置在套杆内，内杆内部中空设置，内杆与套杆的内侧壁之间形成有供清洁饲料流动的通道；内杆上沿内杆的长度方向间隔设置有多个隔板，多个隔板将内杆阻隔形成多个腔室，多个腔室均与通道连通；定位机构设置在套杆上且用于将内杆定位在套杆内。本申请具有改善现有的取样装置难以对储存箱中的清洁饲料进行各个深度的取样的问题，且清洁饲料在多个腔室内能够按照深度顺序进行排布，能够保留清洁饲料在储存箱内的深度顺序的效果。