本发明公开了一种SPI控制器和操作SPI控制器的方法，该SPI控制器包括：SPI时钟信号产生器，其配置为产生SPI时钟信号；寄存器组，其配置为保存所述SPI控制器的SPI工作配置；多个SPI引脚，其配置为连接到一个或多个SPI外设；及输入输出控制器，其配置为根据所述SPI时钟信号及所述SPI工作配置，执行所述SPI控制器与所述SPI外设之间的数据输入或输出；SPI状态机，其配置为控制所述SPI控制器的工作状态；其中所述SPI控制器通过总线电耦合到位于所述SPI控制器外部的CPU、DMA控制器及系统内存；及所述输入输出控制器还配置为在连续的两次SPI传输之间，从所述DMA控制器接收更新的SPI工作配置并将所述更新的SPI工作配置更新到所述寄存器组中。